本经的重要义理，像关于三身十地等说，真谛在翻译之时就已经流行，所以他很重视本经，曾作《金光明经疏》十二卷，阐释其要义。可惜此注疏本已不存，但后来智所著《金光明经玄义》二卷，和《金光明经文句》六卷对真谛之说多有引用，约略可窥见其思想端倪。与智同时代的吉藏也著有《金光明经疏》一卷。
值得一提的是，虽然智者大师与吉藏立说不同，但从师承上看，他们与真谛皆有渊源关系。智者大师出家未久，曾从真谛的弟子慧旷习律学及方等经，是真谛的再传弟子。吉藏幼年亦曾随父拜谒真谛，其名即真谛所授。其后唐代慧沼又就义净本著《金光明最胜王经疏》十卷。慧沼曾师从玄奘、窥基，是中国法相唯识宗的重要代表人物。
此疏从唯识学立场阐释本经要义，详尽而精当，从一个新的理论视角丰富了本经的思想，其中关于佛三身的诠释常被后人所引用。虽然如此，由于三论宗与法相唯识宗于后世宗风不振，少有传承，所以再难见到这两个宗派的其他注疏本。后世真正将本经发扬光大者，首推天台宗。
《金光明经玄义》和《文句》在智者大师的著述中有着举足轻重的地位，与《观音玄义》《观音义疏》《观无量寿佛经疏》并称天台五小部。到了宋代，天台家沿着智者的理路，对此经又有发挥。知礼著《金光明经玄义拾遗记》六卷及《金光明经文句记》十二卷。此外，在与山外派的论战中，知礼著《释难扶宗记》和《十义书》，其理论重心仍是发挥本经，特别是《金光明经玄义》的有关内容。
真谛的注疏本虽已不存，但从智者大师的有关转引看，却有着丰富的意蕴。其间的诸多思路和见解，给后世注疏本经者以极大启发。如真谛诠释本经经名云，“金光明”表示三种三法：一表三身佛果，二表涅槃三德，三表三种佛性。
就三身而言，“金”象征真如理体，譬喻法身佛；“光”象征真如之由体发用，如光明遍照三千大千世界，譬喻应身佛；“明”象征真如能给众生带来法味利益，譬喻化身佛。
就三德而言，“金”的四种属性象征法身四德，具体而言，金色不变如“常”，体无染着如“净”，可随意变现形态如“我”，可使人富贵如“乐”，故“金”譬喻法身；“光”能照耀世界，袪除黑暗，如般若智慧能破除种种无明，故“光”譬喻“般若”；“明”表示光明澄澈，没有任何黑暗与染污，可譬喻没有任何烦恼和患累的解脱状态。
就三佛性而言，“金”喻佛性，为道前正因；“光”喻智慧，为道内了因；“明”喻解脱，为道后至果。
真谛的理论独特性表现在他没有拘泥原来本文的内容，而是“借题发挥”，在原有的概念构架中，灌注自己的思想，这种诠释已不单是注解释义，而且是一种创造性理论构造。在这里，“金光明”三字是否喻指三种三法并不重要，最重要的是，这种注疏方式为后人提供了一种创造性诠释的理路。
吉藏于《金光明经疏》中就全盘接受了真谛对经名的释义。智者大师虽然认为真谛之说未臻圆满，仍属不了义，但其诠释理路却与真谛没什么不同。
真谛的经名释义，实际上反映出他对本经宗旨的理解。佛三身、涅槃三德、佛性三因，或者更概括地说，法身、般若、解脱就是本经立论的核心。法身与三身不可分，般若即空观，解脱是涅槃同义语，三者构成佛、菩萨果位功德，经文的其他内容，如发菩提心、忏悔、灭障、赞叹、布施等，皆是为修得此胜果所发因位善行。
吉藏的《金光明经疏》是依昙无谶所译四卷本《金光明经》而作。吉藏，世称“吉祥大师”，一生精研《中论》《百论》和《十二门论》，对大乘空宗契悟极深。
《金光明经疏》虽然比不上后来智者大师的《金光明经玄义》和《金光明经文句》详尽，但亦可见其诸多独特见解。如经文中说，四佛一齐示现，为妙幢菩萨演说世尊寿量。吉藏认为四佛表涅槃四德，东方不动表常德，西方无量寿表乐德，南方宝相持如意珠有自在力，表我德，北方微妙声唯净无秽表净德。
关于本经主旨是菩提因果还是涅槃因果，当时是有诤论的，依吉藏对四佛的诠释，他倾向于涅槃因果。在解释菩提、涅槃两种乐果时，吉藏将二种生死与之相对称，即解脱分段生死而得菩提，解脱变异生死而得涅槃。唯从变异生死中解脱出来，才是究竟解脱，所以涅槃是极果，发菩提心、修菩提行，最终还是为证得涅槃果。
涅槃是修行果位，法身、般若、解脱，皆果位的胜德，其内涵非有亲证者不能了知，此即吉藏所说：“体不可以智知，相不可以言诠。”或从修行主体方面看，涅槃是佛的境界，万法实性甚深，唯佛与佛能穷其底蕴，一切凡夫二乘乃至菩萨，因种种烦恼惑障而不能解了。
佛即如来，在吉藏看来，如来有三：一是法身如来，未证道时，法性不变称如，证道后法性显现称来；二是应身如来，与真实之道相应称如，体道而成正觉称来；三是化身如来，随机化度众生称如，八相成道称来。欲证得三身如来，有二门二道，一是功德门，即方便道；二是智慧门，即般若道。
功德门，包括忏悔自身业障，赞叹佛、菩萨胜德，广行六度，以种种方便利益众生等等。依此功德，断除业障，因断业障，随宜现身，自在无碍，即有化身。
智慧门，即修空观，明诸法无我，诸行无常，一切本空。依此智慧，断除烦恼障，既断烦恼，与万法真实之理相应，即得应身。由业障、烦恼障一并断灭，则作为烦恼业果的阿赖耶识亦随之断灭不再生起。于此法性身即最终得以显现。所以说，欲证得法、应、化三身，必须修功德和智慧。
引人注目的是，吉藏还对此经做了教相判析，指出“《金光明经》者，乃是究竟大乘菩萨藏摄，是顿教所收”。此处的顿教之顿是就说法的形式而言。
对根器未熟的众生，由浅入深，初说小乘，渐次说大乘之法，称渐教，与此相对，对顿悟之机，自始即讲说深奥的内容，称为顿教。此经不仅通篇围绕大乘菩萨道而展开，而且《序品》之后即是《寿量品》《三身品》，阐发大乘究竟之理，显系对大根器者而发，故属顿教。
前面已经提到，慧沼是依唯识学立场注疏本经的。这特别体现在以三性三相说明三身。唯识学的三身与本经的说法略异。据《宗镜录》卷八十九载，自性身、受用身、变化身称为三佛身。
自性身，指一切万法平等实性所依；受用身分自受用身和他受用身，他受用身指诸如来为住十地菩萨众所现身；变化身，为诸如来以神通力，为未登地诸菩萨众及二乘等所现身。慧沼认为上述三身是可以与法、报、应三身相互说明的。
自性身，具无边际真常功德，相当于法身；自受用身，为诸佛如来修习无量福慧而得恒自受用广大法乐，相当于报身；他受用身，诸如来由平等智示现微妙净功德身，居纯净土，唯地上菩萨方能观见，相当于应身；变化身，诸如来变现无量，随类示现，居净秽土，一切众生悉得化度，相当于化身。
三身是佛如来的果德，唯佛具足三身。而一切凡夫众生之所以不能证得三身，是因为有缠缚有障碍。根本的障碍在于不能如实了知诸法实相，而诸法的真实状态，唯识学以三相来说明，此即遍计所执相（性）、依他起相（性）、成就相（又称圆满成就相、圆满成就性）。
遍计所执相以我执法执为体，依他起相以有漏性为体，而圆成实相则以真如为体。故此，欲解了万法真实相，须于心识加修，转识成智，去染归净。
由修无分别智而悟遍计性，由悟遍计所执性而得化身。修净依他起智，断除一切染着而得应身。由修大圆镜智而断一切业障、一切烦恼，而证圆成实性、显得法身。
成就三身的障碍从外境看即不识万法的三相，从内在的心而言则是三心。在慧沼看来，心有不同的含义，在佛经中提到心略有四义：一是作为真如理体的实相心，或自性清净心；二是缘虑认知之心；三是“积集义名心”，约相当于唯识学中的第七识；四是“积聚最胜义名心”，即第八识。
障蔽三身的三心非自性清净心，而是后三种心，具体说来，起事心属前六识，依根本心属第七识，根本心属阿赖耶识。依唯识宗的说法，起事心指与见修烦恼相应之心，由此烦恼而起事造业；依根本心指与所知障及所发业相应之心；根本心指有苦果相应之心。
欲得三身，须断尽三心，具体说来，能制伏烦恼所知二障，即灭起事心，入见道而不造新业，感生死果，而现随类化身；观诸法本空，断所知障，即灭依根本心，能断除一切业障而得应身；观我法皆空，证最胜道，即断苦果一切习气而显法身。
吉藏、慧沼的注疏虽然对本经经义亦有发挥，时有创意，但总括起来看，没有跳出原经的理论框架，大体停留在以经解经的层次上。真正使本经别开生面，昭示其丰富的内涵、显示其理论开放性的是天台宗。
智者大师所著《金光明经玄义》，以“六经注我”的理论勇气和创造性智慧，借题发挥，谈玄说妙，机辨纵横独出机杼，将本经深蕴之旨发挥得淋漓尽致。
《玄义》分上、下两卷，上卷后世称略本，下卷则称广本。上卷开卷即围绕“金、光、明”三字展示出天台家的思想特色。前面提到，真谛等以“金”譬真如、佛性和心；以“光”譬知、观照；以“明”譬事、资具和解脱。
智者认为以上譬喻并没有涵盖“金光明”所有内涵。其实“金光明”是法性的代称，无所不包、无所不统，所谓：“当知三字遍譬一切横法门，乃称性无量之说；遍譬一切竖法门，乃称法性甚深之旨；方合经王一切遍收，若长若广、教无不统。”
《玄义》列举“十种十法”，从三个角度，十个方面阐述了作为法性显现的一切法相即互融的关系。
第一是“标十数”，即从无穷无尽的解脱法中，选取十种来概括从此岸世界到彼岸世界的历程，此即三道、三识、三佛性、三般若、三菩提、三大乘、三身、三涅槃、三宝、三德。
此十法可从“三道”顺推至“三德”，称“从无明为本立一切法”；又可从“三德”依次逆推至“三道”，称“从无住本立一切法”。无论是顺推还是逆推，都是为了证明“是为一三法门具九三法门，亦具一切法门”，即一法含一切法，法法互具。
第二是“释十相”，即就“标十数”中所选的十种法，对每一种都从三个方面展开，并解释三个方面的内在区别与联系。“十相”排列如下：
《玄义》开列此十法门，并把“十种三法”中的每一项都推演到“常乐我净”上去，是为了说明法法皆是法性或佛性的显现，佛性无时不在、无所不在。
此十法门从宗教修行角度看，实际上是描绘出了由凡夫众生到成就佛果的途径和阶段，从“三道迷惑，翻惑生解，即成三识”开始，直到“究竟寂灭入于三德，即成秘密藏也”。如果从三道开始就包含着“常乐我净”，而直到三德终于成就“秘密藏”，圆满佛性，则一切众生悉有佛性即是不言自明了。
第三是“简十法”，简是简别，即对藏、通、别、圆四教，对以上十法的不同理解进行分析，否定前三教，肯定天台宗所代表的圆教。
《玄义》认为，藏教讲法身在前、般若在中、解脱在后，前后历然，三法各异，此之三意，悉不得称常乐我净也。通教讲法身是本有，般若是今有，解脱是当有，同样是从纵的方面对它们作分别解，也不能称常乐我净。
以真谛的理论为代表的别教，则是从横的方面对三德作分别解，依照他们的说法，法身可称为德，般若、解脱无德可称。
以上三说于三德的认识及解说，皆非究竟了义，都没有从根本上说明法身、般若、解脱与常乐我净的关系。
智者大师于《玄义》中讲到圆教则认为，法身、般若、解脱一一皆具常乐我净，无论从纵的方面还是从横的方面，三者之间的关系都是相即互融的。
《玄义》上卷以纯一的法性显现为无限法门及佛性的周遍性，表现了“一念三千”及“三谛圆融”等天台宗根本理论，不过在这一部分并没有强调“一念”是如何显现为“三千大千世界”的，也没有说明通过什么样的修习途径而达到成佛的境界。这部分有关具体的宗教修习的内容是在《玄义》下卷说明的，此即观心说。
《玄义》卷下开篇明义：“上来所说专是圣人圣宝，非己智分，如鹦鹉学语，似客作数钱，不能开发自身宝藏。今欲论道前凡夫地之珍宝，即闻而修，故明观心释也。”即是说上卷所论法性、佛性，圣人不须见思闻修，当体即证得，而凡夫众生则需要“即闻而修”。
实际上，上卷所讲的佛性与下卷所说的心，在本质上是一致的，此心就其作为真心或自性清净心而言，当体即佛性，而作为妄心或一念妄识，亦不离佛性，故此通过观心即能开发自心内部的佛性，直至成佛。
《玄义》引《维摩诘经》曰，诸佛解脱，当于众生心行中求。心是众生烦恼的根本，亦是众生解脱烦恼的根本，观心实相即解了万法实相，即得无碍解脱。天台观法即一心三观，亦即谛观一念之心，即空即假即中，即中是金，即空是光，即假是明。《玄义》卷上所列十种三法，皆可作此观。如谛观一念心，即是三身。
《华严经》云：心如工画师，造种种五阴，若心缘破戒事即地狱身，缘无惭愧、憍慢、恚怒等即畜生身，缘谄曲名闻即饿鬼身，缘嫉妒诤竞即修罗身，缘五戒防五恶即人身，缘十善防十恶、缘禅定防散乱即天身，缘无常苦空无相无愿即二乘身，缘慈悲六度即菩萨身，缘真如实相即佛身。
若能观五蕴皆空，心所生一切诸身皆空无所有，则为即空，即空即是报身。为方便救度一切众生，佛如来示现六道身，能观六道身皆随缘示现，是为即假，即假即是应身。五蕴本空而又六身宛然，是为即中，即中即是法身。
又如谛观一念之心，即空即假即中，诸佛以即中为体，故名法身；以即空为命，故名般若；以即假为力，故名解脱。一一皆常乐我净，没有欠缺，故称三德；一一皆是法界，多所含藏，故称秘密藏。
智者大师在《玄义》下卷认为，对一切凡夫众生来说，观心起修对成佛具有决定作用。虽说一切众生皆具佛性，或说“夫有心者即具法界法性金光明”，但此时的心只有金光明的假名而已，称“名字金光明”；如果能念念修观，心心相续，即是“观行金光明”；如果观行圆满，究竟明了，才是“究竟金光明”。
可以说，《玄义》上卷与下卷是相互配合的，上卷明“性”，下卷明“修”；上卷讲“理体”，下卷讲“事观”，整部《玄义》比较全面地贯彻或体现了天台宗“一念三千”“三谛圆融”及“止观并重”“定慧双修”的根本思想。
但天台宗发展到宋代，围绕《金光明玄义》广略本，却展开一场长达七年的大论战（从宋真宗咸平三年至真宗景德三年）。论战的一方以天台宗第十七祖知礼为代表，自称山家。另一方被他们称为山外，代表人物有庆昭等。诤论的焦点是“真心观”与“妄心观”，通过双方反复辩难，将智者在《玄义》下卷中阐发的观心思想具体化、系统化。
知礼的有关思想集中于《释难扶宗记》《十义书》等书中，虽然其晚年曾著《金光明经玄义拾遗记》和《金光明文句记》等，但基本是早期著作中观点的综述和重复，新意不多。
山外派的著作，由于山外派是这场论战失败的一方，后世天台宗基本是山家后裔，所以大都散佚不传。只知道晤恩曾作《金光明玄义发挥记》，洪敏、源清作《难词二十条》，庆昭著有《辩讹书》（与智圆合著）、《答疑书》《五义书》《释难书》等。这些著作俱不存，但从知礼有关著作中约略可窥知其基本观点。
这场诤论的缘起，是晤恩、源清、洪敏等著文非议《玄义》略本（即下卷），认为这部分文字文理乖舛，是后人擅添。其立论的核心是否定《玄义》的观心说。如《难词二十条》第一条云：“一一三法，无非妙性，一一妙性，尽是真源；若法若心，即金光明不可思议法性。岂有如此纯谈法性之外，别有观心者？”
山外派的庆昭在《答疑书》中讲：“今之玄文（《金光明玄义》）虽带十种法相，其如并以法性贯之。法性无外，即我一心；若识一心，则了诸法。何独于一念中，识十种三法？乃至无量三法，若横若竖，罔不照之，全我一念。岂此之外而有法相不融，更须附法作观乎？”
庆昭认为，《玄义》上卷中的“十种三法”，能够直接显示心性，而法性不是外在的，乃是“一心”。如果体认此“一心”，则解了诸法实相，不需要再于“一念”中按照“十种三法”去依次作观想。
从心性的角度分析，则在山外看来，“修”与“性”是合而为一的。知道关于“性”的教理也就自然达到“修”的目的。以上“一心”与“一念”的区分，后来逐渐明确为“真心”与“妄心”的区别。
真心即本心，或自性清净心，此心是与法性相贯通的；妄心即识心，或攀缘思虑之心。从染净的角度论，则真心非染非净，心佛众生三无差别之心即此心。而妄心则属染法，随种种机缘不同而瞬息万变。
庆昭等人认为理解了真心，就不必再对妄心作观想，也就是说，他们否定《玄义》广本，并不是不要观心，而是认为只要“理观”，或观“真心”就足够了，不必再去作“事观”，或观“妄心”。庆昭在《辩讹书》中讲得明白：“观有二种，一曰理观，一曰事观，今云不须观心，乃不须附事而观也。”
知礼则认为《玄义》下卷决不是可有可无的，上卷所明十种十法只是果位所证，即只有达到佛的果位后才能证得，并不是任何人都当下直显心性。要明达心性，必须有“观心”的过程。否则，即便解了佛的果德，也不能实际证入。
为形象地说明这一观点，知礼以“开发自身宝藏”为喻，讲“虽知金藏而不耘除草秽，何益贫穷者哉”。“观心”即“耘除草秽”，知礼认为非如此便不能发现佛性。
值得注意的是，知礼这里所讲的观心是指观妄心。依知礼的思路，真心是“不思议境”，它本身非染非净，却是一切染净法的根据。要显示此真心，就要以十乘妙观去修断无始无明与无明之果之间的因果联系，修断的对象即妄心，或一念阴识。
在知礼看来，凡夫众生因贪、嗔、痴等种种染缘，而堕于生死轮回中不能自拔，只有针对此种妄心来作观想，经过一番修证功夫，才能证得佛界心，从而摆脱生死轮回而进入佛界。
真心观与妄心观的诤论，还有更深刻的心性论根源。在山外论师，心性有时作分别解，所谓心是真，性是妄。但通常是以心性指真心。此心随缘现为众生之心及佛心，庆昭认为：“缘有染净，随染缘作九界心，随净缘作佛界心。”
山外派虽然承认缘有染净，心有真妄，但作为本源的心，即与法性一体的心，则是非染非净、非迷非悟的。而且山外派还受华严宗思想的影响，将此心认作理体，而将佛众生及一切事物，都看作事相，二者之间是能造与所造的关系。这里所说的“造”，不是宇宙生成论意义上的事实的生成，而是显现。
这里所说的佛与众生也不是指肉身的佛与众生，而是指主体或迷或悟的实存状态。从终极意义上说，佛与众生皆有“真心”，但就每一个体的修行实践而言，则有迷与悟或觉与不觉的差别，迷则为众生，悟则为佛。由迷到悟的过程，也就是体证非迷非悟的真心的过程。
值得注意的是，在山外派看来，作为根本的心绝对是非染非净的。庆昭：“乃谓须是非染非净之心，方能造于如来，全不许妄染之心造如来也。”
知礼认为，山外派将心性界定为真心，并以此真心与果佛所证直接贯通，将修行过程归为观真心以“直显心性”，从理法上讲，“此则全乖阴识理具佛性之义，又云‘烦恼之俦为如来种’之文，又违‘性指三障’之说，又只知类种，全不识敌对种也”。从事法上讲，这种觉与不觉全在一念迷悟的思路，实际上是否定了对事相、法相的认识，取消了由凡入圣有严格限制的循序过程。
这里涉及天台宗一个重要概念“敌对种”，智时称为“相对种”，指相依相待、互相反对的事物，如“阴识理”与“佛性”、“烦恼之俦”与“如来种”、“性”与“三障”等等。
天台宗还有另一重要思想即“敌对相即”。依照这一原则，一切对立的事物不仅“互具互容”，而且相即不离。这种相即性具有重要的现实意义，因为只有“敌对种”，即有差异的事物之间既相对立又相即不离，才有相互产生的可能。只具有同一性的事物（“类种”）或完全相对而不相即的事物，皆不能相互产生。
具体而言，“非染非净之心”与“如来”是“类种”，不能相互产生；而“妄染之心”尽管与“如来”有差异，但正是在克服妄心过程中证得如来。故此所观之心不应是“非染非净之心”，而应该是“一念妄心”。
上面已提到，欲证得三身如来，有功德门和智慧门两门。《金光明经》所讲的空观，以及智者、知礼等所阐述的观心等，都可归于智慧门。至于功德门，则包括六度万行一切行法。
就《金光明经》提出且在后世不断得到阐扬和奉行的，是忏悔法。具体言之，即“金光明三昧忏”。本经《忏悔品》和《灭除业障品》说明了忏悔的宗旨、内容、行法和对灭除业障的意义。到天台宗创立，金光明忏法受到重视且有了相应的仪则。
依隋灌顶集《国清百录》卷一载，欲行此忏法，首先庄严道场，安置唱经座，设列幡华，佛座之左为功德天座，右为四天王座，诸座各烧香散华。行者日日洗浴，身着新净衣，手执香炉，一心顶礼十方常住、一切三宝；然后三请诸佛、菩萨、圣僧、诸天、诸神，一心虔述行忏之意，三唱宝华琉璃世尊、《金光明经》、功德天，自归后方，共坐食，仪式结束。此系午前的行法，其他则唯专唱诵《金光明经》，凡七日七夜。
宋代遵式曾依据本经撰《金光明忏法补助仪》，设立十科，详明其轨式如下：严净道场方法，道场内须安置释迦像，于像前置《金光明经》，以虔敬至诚心供养三宝；清净三业方法，日日沐浴，无闲杂语，不念世俗杂事；香华供养方法，如法礼敬三宝，并唱：“愿此香华云，遍满十方界，供养一切佛，尊法诸菩萨，声闻缘觉众，及一切天仙，受用作佛事。”召请诵咒方法，当胡跪佛前，手执香炉，烧众名香，一心奉请诸佛、菩萨及诸天尊，并诵持相应的咒语。
赞叹述意方法，面对法座，赞叹诸佛世尊的相好庄严及功德智慧。称三宝及散洒方法，称三宝即称念：“南无宝华琉璃佛，南无《金光明经》，南无第一威德成就众事大功德天。”散洒即以种种饮食恭持奉献诸佛世尊、菩萨圣贤、天部圣众，又以饮食散掷诸方，遍施诸神。
礼敬三宝方法，礼敬诸佛，当一心专念此佛法身犹如虚空，应物现形，如对目前，受我礼拜。尔时专心一念，自知身心空寂，无能礼所礼，礼法僧亦然。
修行五悔方法，为灭诸罪业，当行五法：一于十方佛至心亲近，说一切罪，二为一切众生劝请诸佛究竟妙法，三随喜一切众生所有功德，四所有善根悉皆回向无上菩提，五祈愿佛、菩萨及诸天圣众常来护持，使此国众生灭除诸障，归趣涅槃菩提。
旋绕自归方法，右绕法座，安详徐步，唱道：“自皈依佛，当愿众生体解大道，发无上心；自皈依法，当愿众生深入经藏，智慧如海；自皈依僧，当愿众生统理大众，一切无碍。”
唱诵《金光明经》方法，应一心正念，文句分明，音调不缓不急，应了音声性空，而又充满法界，供养三宝，普济众生，令其同入金光明法性海中。
此外，宋代知礼亦撰有《金光明最胜忏仪》，以说明其行仪，但内容大都重复前人，少有新意。还有宋遵式曾依本经《四天王护国品》而著《金光明护国仪》，阐释护国法会的仪则。
据说宋仁宗看到其中的发愿文有“诸天威神护持我国圣帝仁王，慈临无际”，抚几叹曰：“朕得此人，可以致治。”（见《佛祖统纪》卷四十五）
宋以后，有明代受汰集《金光明经科注》四卷，附有《金光明经感应记》。此集注在理论上已无新意，于本经思想传录，仅为余绪耳。
此经在唐代由中国传到日本，由于此经阐扬了天王护国思想及袪病攘灾思想，所以受到日本天皇的推崇，并在日本古代政治生活和宗教生活中，产生了很大的影响。
据史籍记载，天武四年（公元六七五年），朝廷遣使诸国（即当今的县），崇奉《金光明经》，天武八年（公元六七九年），开始在宫中和诸寺讲说此经。此后的持统、文武天皇等朝亦盛讲此经。此时所用讲本是西凉昙无谶的四卷译本。
圣武天皇养老二年（公元七一八年），道慈从中国带回义净所译十卷本《金光明最胜王经》，遂取代旧本，成为流行本。圣武天皇神龟五年（公元七二八年），朝廷书写金字《最胜王经》六十四部，每国颁一部，并令转诵，祈祷国家平安。
天平十年（公元七三八年），令各国各造金光明四天王护国寺（僧寺）及法华灭罪寺（尼寺）各一座，并令各造七重塔一座，安置天皇所颁金字《最胜王经》。
天平十三年（公元七四一年），在下诏各国设国分寺、国分尼寺的同时，诏令僧尼每月八日必须诵《最胜王经》。此经已成为日本佛化政治的标志之一。
从日本佛教宗派体系看，此经主要为三论宗所崇尚，此外唯识宗及真言宗对此经亦有所发挥。将义净本带回日本的道慈即日本三论宗的重要代表人物。
他在中国求学期间，曾师从嘉祥大师吉藏的法孙元康受空宗的奥义。虽然后来三论宗成为真言宗附宗，日渐式微，但《最胜王经》与三论宗的特殊因缘却得到后世的认同。
公元九世纪，元兴寺愿晓等集前人注疏（大荐福寺胜庄注、西明寺慧沼注、新罗元晓、憬兴注）再加上自己的理解，作《金光明最胜王经玄枢》十卷。在开题中，愿晓明言以嘉祥大师的注疏为依据，以三论宗义为根本。在愿晓看来，只有嘉祥大师的注疏才揭示了此经的奥旨，其他注本皆非究竟了义。从愿晓的注疏看，他对三论的中道义确实契悟很深。
如在《如来寿量品》“法身是正觉”条，愿晓发挥空义云：“空有三义，一有空，明有物不成就，如人法二我，体非有故；二无空，人法二我为无，此无即成有。非谓为无，若无，于何为无也？若无此无，此无无自性，又不成无。若是有，有复非无性，亦不成无，故言无空；三非有非无空，二处一味故。一有空，明有非有；二无空，欲显无非无。即无定有定无，是显非有非无。初二乘道，次菩萨道，第三通会一切三乘，入于中道。”
“空”是超言绝相的，所以不能用经验层面上的“有”这一概念去描述。但空虽无名相而体性不虚，一切万法皆空的显现，空遍一切处，故空又非通常意义上的无。这种有亦空、无亦空、非有非无亦空的“空”，便是《中论》依“离二边”“泯二际”所获得的“毕竟空”。
除《金光明最胜王经玄枢》外，明一所集《金光明最胜王经注释》十卷和平备撰《最胜王经羽足》一卷亦是值得重视的著作。明一和平备的注释带有明显的唯识学思想倾向。如在《重显空性品》的释题中，明一云：“空性三：一者空即是性，即遍计所执我法二种；二者空之性，即真如是空之真性，因空所显，故云空性，非体性空；三者依他亦名空性，名无生性故。”
空与空性是有区别的，空指万法皆因缘所生，无自性，故体性空。空性则指万法之真如理体，此真如无生无灭，非有非无，为空之真性。用唯识学的概念来表达，则遍计所执性即空，依他起性即空性。
弘法大师空海的《最胜王经开题》一卷，将此经归于秘密部，谓此《金光明最胜王经》“即是诸佛之秘宝，众经之密藏”。其徒真圆权律师作《金胜王经秘密伽陀》，供信众唱诵，此经遂成为日本真言宗奉持的重要经典之一。