《指月录》与其他经论不同，主要是由一则一则的公案组成，相对于它的源头，即各种灯录、语录，并不存在思想精神上的发展变化，所以只能在书的编集方面溯其源，就书的影响方面述其流。
说到《指月录》之流，则有清代聂先的《续指月录》，较为简单，而说到《指月录》之源，则是非常复杂的。瞿氏在《指月录》的序中说：“予垂髫则好读竺坟，尤好宗门家言。……意适处，辄手录之。”可见《指月录》是从这些“宗门家言”中摘录出来的。
这些“宗门家言”到底有哪些书籍？我们从书中以夹注形式出现的附录中提到的书名，大致可以判定有如下著作：北宋道原《景德传灯录》，契嵩《传法正宗记》，南宋宗杲《正法眼藏》，普济《五灯会元》，明居顶《续传灯录》，唐道宣《高僧传》，智炬《宝林传》，北宋赞宁《续高僧传》，惠洪《禅林僧宝传》，《智证传》，《林间录》，延寿《宗镜录》，克勤《碧岩集》，南宋赜藏主《古尊宿语录》，道谦《大慧普觉禅师宗门武库》，晓莹《罗湖野录》，南宋法应（集）、元普会（续集）《禅宗颂古联珠通集》，南宋宗永《宗门统要》，以及《大慧语录》《庞居士语录》《坛经》《雪堂和尚拾遗录》《临济语录》《圣胄集》等。
此外正文中也明确标出了所引的一些经论。可见《指月录》抄录的范围是相当广泛的，辨析起来也是相当复杂的。下面拟从内容和形式两个方面对《指月录》的渊源进行辨析。
《指月录》内容由两部分组成，一部分是正文，一部分是附录。下面首先考察一下正文的情况。
《指月录》虽然没有取名灯录，而“指月”的意思是要人们因此书而见道，但它实际上是一种灯录。其源头就是前面流传的各种灯录。最早的灯录应该是南唐保大十年（公元九五二年）泉州招庆寺静禅师和筠禅师编的《祖堂集》。但《指月录》当中并没有提到这部书，内容上也没有引用过。
据陈士强先生考证：“《祖堂集》初刊后不久，留在国内的印本由于战乱等原因，大多散佚。除北宋尚有人看过它以外，南宋以后极少有人提到过它。以至后人几乎不知道有这部书。又由于以‘传灯录’为书名的，以北宋道原的《景德传灯录》为最早，故一般都认为《传灯录》是禅宗灯录体著作的始祖。这从对后世的直接影响而言，是完全对的。”（《佛典精解》，上海古籍出版社一九九二年十一月版，第五五九页至五六一页）
所以《指月录》所取的灯录应该是北宋道原的《景德传灯录》（简称《传灯录》）、李遵勖的《天圣广灯录》（简称《广灯录》）、惟白的《建中靖国续灯录》（简称《续灯录》）、南宋悟（《续藏经》作“悔”）明的《联灯会要》（简称《联灯》）、正受的《嘉泰普灯录》（简称《普灯录》）、普济的《五灯会元》（简称《会元》）、明居顶的《续传灯录》。
应该取自这些灯录，实际是不是真的取自这些灯录呢？从书中附录看，《传灯录》《会元》《续传灯录》是肯定的，其他灯录则没有明确说明。附录中有时只说“灯录”二字，到底是指哪一部灯录，还不清楚，但可以肯定不光是指《传灯录》。因为《传灯录》只收到南岳下第九世、青原下第十一世，而《指月录》在此后的世系中仍然出现“《灯录》云”之类字样。
例如六祖下第十五世《丞相张商英居士章》便有“《灯录》《武库》皆不载其颂”语，六祖下第十六世《安吉州道场明辨禅师章》附录中有“与《灯录》小异，附志于此”语。这两处说的《灯录》肯定不是《传灯录》。书中六祖下第十三世之前的附录中也常常出现“灯录”的字样，这些《灯录》具体指哪一部灯录，只能具体考察了。
在众多的灯录当中，对于《指月录》来说，《五灯会元》有着特别重要的意义。只要对照一下两部书就会发现，《指月录》在摘抄过程中尽管参照了许多种书，但落实到具体文字上大部分是以《会元》作为蓝本的，也就是说其他灯录可能与《会元》内容相同，而个别字句不一样，而《指月录》则与《会元》一致。
例如《释迦牟尼佛章》，《会元》前一部分与《传灯录》相同，后面许多内容《传灯录》没有，《广灯录》不同于《会元》，《续灯录》不同于《会元》，《联灯》内容相近而多出后人拈颂，《普灯录》不同，而《指月录》全章与《会元》全章基本相同。再如东土祖师《初祖达磨章》，《会元》与《传灯录》相同，《广灯录》增加许多谶言偈语，其他相同，《联灯》相同，《普灯录》不同，而《指月录》取自《会元》。再如六祖下第二世《马祖道一禅师章》，《会元》与《传灯录》相同，《广灯录》不同，《续灯录》相同而不全，《联灯》相似，而《指月录》取自《会元》。
所谓取自《会元》，也不是一字不差地照抄，而是相对于其他灯录，《会元》更为接近，可以判定是取自《会元》。例如《马祖道一禅师章》第一段，《传灯录》《会元》《指月录》分别如下：
江西道一禅师，汉州什邡人也。姓马氏。容貌奇异，牛行虎视，引舌过鼻，足下有二轮文。幼岁依资州唐和尚落发，受具于渝州圆律师。唐开元中，习禅定于衡岳传法院，遇让和尚。同参九人，唯师密受心印。始自建阳佛迹岭，迁至临川，次至南康龚公山。大历中，隶名于开元精舍。时连帅路嗣恭聆风景慕，亲受宗旨，由是四方学者云集坐下。
江西道一禅师，汉州什邡县人也。姓马氏。本邑罗汉寺出家。容貌奇异，牛行虎视，引舌过鼻，足下有二轮文。幼岁依资州唐和尚落发，受具于渝州圆律师。唐开元中，习禅定于衡岳山中，遇让和尚。同参六人，唯师密受心印。始自建阳佛迹岭，迁至临川，次至南康龚公山。大历中，隶名于钟陵开元寺。时连帅路嗣恭聆风景慕，亲受宗旨，由是四方学者云集座下。
江西道一禅师，汉州什邡县人。姓马氏，故俗称马祖，或云马大师。容貌奇异，牛行虎视，引舌过鼻，足下有二轮文。幼岁于本邑罗汉寺出家，受具于渝州圆律师。开元中，习定于衡岳，遇让和尚，发明大事。同参六人，唯师密授心印。始居建阳佛迹岭，迁于临川，次至南康龚公山。大历中，连师路嗣恭请师开法，四方学者云集座下。
可见《传灯录》与《会元》基本相同，《指月录》则略有不同，但它取自《会元》。《传灯录》云“同参九人，唯师密受心印”，《会元》作“六人”，《指月录》亦作“六人”。《传灯录》云“四方学者云集坐下”，《会元》作“座下”，《指月录》亦作“座下”。《会元》云“本邑罗汉寺出家”，《指月录》云“幼岁于本邑罗汉寺出家”，而《传灯录》则没有这些字样。但也可以看出，《指月录》在行文当中有意省略。《传灯录》《会元》俱云“大历（《传灯录》作“历”）中，隶名于钟陵开元寺。时连帅路嗣恭聆风景慕，亲受宗旨，由是四方学者云集座下”，而《指月录》但云“大历中，连帅路嗣恭请师开法，四方学者云集座下”。
而且《传灯录》《会元》中“密受心印”下面有一百二十三字的附录，《指月录》则没有，但它在“南康龚公山”下加上六十三字的附录。《指月录》在个别地方还有少许增加。《会元》云“遇让和尚。同参六人，唯师密受心印”，而《指月录》在“遇让和尚”后面加入“发明大事”四字。
《马祖》一章，《指月录》取自《会元》而不取《传灯录》，在后面的段落中还可以找到许多例证。如《会元》《指月录》当中都有马祖与西堂、百丈、南泉玩月一则公案，而《传灯录》则没有。公案云：“一夕，西堂、百丈、南泉随侍玩月次，师问：‘正恁么时如何？’堂曰：‘正好供养。’丈曰：‘正好修行。’泉拂袖便行。师曰：‘经入藏，禅归海，唯有普愿独超物外。’”
再如《传灯录》云：“有小师行脚回，于师前画个圆相，就上拜了立。师云：‘汝莫欲作佛否？’云：‘某甲不解捏目。’师云：‘吾不如汝。’小师不对。”而《会元》与《指月录》具有小师之名，即云“有小师耽源行脚回”。当然在这一章中，《指月录》又加入了《会元》中所没有的一些语录。
再看看《广灯录》。《释迦牟尼佛章》，《广灯录》与《会元》《指月录》都不一样。再如《四祖优波毱多尊者章》，《广灯录》与《会元》相似，而《指月录》还是取自《会元》。末尾《广灯录》云“当平王朝也”，《指月录》《会元》俱云“即平王三十一年庚子岁也”。
对比一下《联灯》与《会元》，《指月录》也是取自《会元》而不取《联灯》。还以《马祖章》为例，《联灯》云：“江西道一禅师，汉州什邡县人，马氏子也。示众云：……”那些关于马祖何时出家，何时受戒，容貌如何奇特，如何开悟，如何开始传法，一概不录。
再如《南岳怀让禅师》一章，《联灯》云：“南岳怀让禅师者，金州杜氏子。少习毗尼。”而《会元》云：“南岳怀让禅师者，姓杜氏，金州人也。于唐仪凤二年四月八日降诞，感白气应于玄象，在安康之分。太史瞻见，奏闻高宗皇帝。帝乃问：‘是何祥瑞？’太史对曰：‘国之法器，不染世荣。’帝传敕金州太守韩偕亲往，存慰其家。家有三子，唯师最小。炳然殊异，性唯恩让，父乃安名怀让。年十岁时，唯乐佛书。时有三藏玄静过舍，告其父母曰：‘此子若出家，必获上乘，广度众生。’至垂拱三年方十五岁，辞亲，往荆州玉泉寺，依弘景律师出家。通天二年受戒后习毗尼藏。”而《指月录》除个别字句以外，基本上与《会元》相同，可见《指月录》不取《联灯》。
比较一下《普灯录》《会元》《指月录》，也可以看出《指月录》取自《会元》而不取《普灯录》。
说《指月录》以《会元》为蓝本，是就大体情况而言，并不是说只取《会元》一家。瞿氏在编集过程中常常是对照许多种书，择善而从，或引入新的内容，或纠正其中的错误。例如六祖下第四世《洪州黄檗希运禅师章》中，禅师在洛阳行乞遇一老妪事，后面的附录云：“添钵公案，《会元》《颂古》《统要》，皆作临济，此从《古尊宿语录》及《林间录》入师章。”六祖下第八世《四祖山清皎禅师章》末尾附录云：“《传录》载此，以师先十八年而识化期也。《会元》作临终时偈，失矣。”六祖下第十世《襄州谷隐山蕴聪慈照禅师章》末尾附录云：“‘深山岩崖’语，今载《会元》矣。”
从上面附录中可以看出，作者是大量地阅读了那些“宗门家言”而摘录出来的。除了几部灯录以外，其他各种传记、语录都用来进行参考，有的还是非常重要的参考。如《六祖》一章，就主要取自《坛经》。抄录时用得最多的书当属《正法眼藏》《宗门统要》《古尊宿语录》《林间录》《禅宗颂古联珠通集》等书。
从那些附录当中还可以看出，瞿氏在摘录过程中，虽文字有些变化，但多限于对其身事叙述的详略上，而对于机语则很少有所变动，态度是极其严谨的。如六祖下第五世《仰山慧寂》一章中“师卧次，僧问曰：‘法身还解说法也无？’”的第二个“法”字下面有附录云：“《会元》无‘法身’‘法’字，《统要》《颂古》等皆有‘法’字。”可见瞿氏对一个字都是非常认真的。
以上是正文部分的情况，下面再看看附录部分的情况。
《指月录》中的附录也是一个重要的组成部分，少则几个字，多则几千言。像“临济三句”和“洞山五位”下面的附录都有六千多字。这些附录的内容大体有以下几个方面：
一、辨证得失，说明摘录依据。如《释迦牟尼佛章》中讲佛降生时间“当此土周昭王二十四年”下面附录云“《正宗》作九”；讲到佛入正定三昧时间“乃于穆王三年癸未”下面附录云“《正宗》作三十三年戊寅”。再如六祖下第三世《池州南泉普愿禅师章》中附录便有“某字应作殊”“某字应作离”“此处有脱误，原录如是，始因之”等字样。再如前面提到的六祖下第八世《四祖山清皎禅师章》中指出《会元》错误的附录，都属于这一类。
二、附载资料，以备进一步考证。如六祖下第七世《韶州云门山光奉院文偃禅师章》讲到禅师参雪峰义存得法事下面附录云：
圆悟《碧岩集》云：“师承睦州旨，往见雪峰。一到便出众问曰：‘如何是佛？’峰云：‘莫寐语。’师便礼拜。一住三年。雪峰一日问：‘子见处如何？’师云：‘某甲见处，与从上诸圣，不移易一丝毫。’《僧宝传》：“谒雪峰，峰方堆桅坐，为众说法。师犯众出，熟视曰：‘项上有三百斤铁枷，何不脱却？’峰曰：‘因甚到与么？’师以手自拭其目，趋去。峰心异之，明日升座曰：‘南山有鳖鼻蛇，诸人出入好看！’师以拄杖撺出，又自惊栗。自是流辈改观。三录载师见雪峰事，其不同若此，因并录以备考。
再如六祖下第十六世《安吉州道场明辨禅师章》末尾附录云：
《萝湖野录》载师悟缘自“闻僧举”至“默有所契”下乃云：“即趋龙门坐据居无何，佛眼举前话问之。师拟对，佛眼以手托开。师趋出，豁然大彻，复回吐露，佛眼拽杖逐之。”与《灯录》小异，附志于此。
三、征引后人关于某一公案的拈颂，以备参看。这种内容在附录中所占比例极大。如《释迦牟尼佛章》，讲到世尊在灵山会上拈花示众，迦叶破颜微笑事，下面附录云：
白云端云：“迦叶色虽然如是，还觉顶门重么？”复颂云：“尽说拈花微笑是，不知将底辨宗风。若言心眼同时证，未免朦胧在梦中。”僧问云峰悦：“灵山拈花意旨如何？”悦云：“一言已出，驷马难追。”“迦叶微笑意旨如何？”悦云：“口是祸门。”
所引的人当以雪窦重显、大慧宗杲、圆悟克勤等人为最多。
四、编者对某一公案的评议。如应化圣贤《金陵宝志禅师章》讲到“安乐禁”时，作者附录云：
幻寄曰：志公“安乐禁”及“十二”，其旨与达磨之不识、德山棒、临济喝，皆自灵山拈花一脉相承。如涂毒鼓，如太阿剑，闻之者丧，婴之者断，不可以心思意解者。而或者谓“十二”乃十二因缘治惑药也。其在书字时节刻漏中，乃书之在十二时中也。“安乐禁”，禁者，止也。至安乐时乃止耳。此所以为修习也。是以赵州庭柏，为三界唯心，沩山拂子，为附物显理者。同道座主奴也，何足以语此？
这一种内容虽然不多，却可以看出编者的思想情况。
以上几种内容除了第四种是作者自己的创作以外，主要来自以《联灯》为主的灯录，以《古尊宿语录》为主的语录和各种传记。例如六祖下第三世《庞蕴居士章》中讲庞居士参马祖得法旨事下附录云“《大慧语录》云”，章末附录又云“士语录载”等，都明确指出了某段话来自某语录。总的说来，正文来源以各种灯录为主，附录以各种语录为主。
下面再考察一下《指月录》在形式上的渊源。
一般灯录大都以“南岳下某世”“青原下某世”来标世次，而《指月录》全以“六祖下第几世”来划分世次。这一做法来自于明代居顶的《续传灯录》。不过《续传灯录》不言“六祖下某世”，而是言“大鉴下第几世”。《指月录》略去了“某禅师法嗣多少人”的第二级标题，改在总目录中用小字注出。这又是采用了《普灯录》的做法。如“江西马祖大寂道一禅师”下面注云“南岳一世”，“庆元府雪窦明觉重显禅师”下注云“青原九世，云门三世”。
《指月录》附录的体例也不是独创，早在《传灯录》中就已经有了，正如陈士强指出的那样：“《传灯录》卷文中刊有一些夹注。根据意思分辨，有宋刻本注、延祐重刻本注和道原、杨亿原注三种。一般说来，宋刻本和延祐本的夹注，多带有校勘辨析性质，数量较少。……道原、杨亿的原注，数量较多，大多是摘引各家禅师之语，对卷文中提到的机缘语句进行评点。如‘玄觉云’‘药山云’‘洞山云’‘石霜云’‘法眼云’等等。”（《佛典精解》，上海古籍出版社一九九二年十一月版，第五八三至五八四页）但其中许多夹注，《指月录》并未摘取。
后来《联灯》在这方面大量地以夹注形式附载禅宗名宿的拈颂评唱，多为《指月录》所吸收。如《释迦牟尼佛章》讲到佛出世后说“天上天下，唯吾独尊”时，附录云：“云门云：‘我当时若见，一棒打杀与狗子吃，贵图天下太平。’琅琊觉云：‘云门可谓将此身心奉尘刹，是则名为报佛恩。’云峰悦云：‘云门虽有定乱之谋，且无出身之路。’”
这三则《指月录》全部保留，此外又加两则。再如《六祖章》中，“风幡之议”下面，《联灯》附载了雪峰义存、巴陵颢鉴、雪窦重显、保宁仁勇四则评语。《指月录》取了前三则，又加入了三则，略去了保宁仁勇一则。
《指月录》许多卷末附有《音释》，这是取法于《普灯录》。
上面辨析了《指月录》的渊源，下面再看看《指月录》的流变。
《指月录》问世后，流传相当广泛，影响颇大。八十三年后，即康熙十七年（公元一六七八年），终于出现续作，聂先《续指月录》。该录共二十卷，收入《续藏经》，上海涵芬楼影印本，第壹辑，第贰编乙，第十六套。聂先，号乐读，庐陵（今江西省抚州市）人。他在书前的《凡例》中说：“是录起于丁巳春至，成于戊午长夏。鸠工始于嘉兴楞严寺之藏经坊，终于维扬建隆寺之印经寮，缮稿于张剑园居士之般若阁。”
可见聂氏是在清康熙十六年（公元一六七七年）春天动手，到第二年的夏天完成的。陈士强说康熙十八年，并不确切。还可以看出，作者是在佛寺的藏书印经之处完成的，时间比较集中，并不像瞿汝稷那样在家中长时间随手摘录而成。余怀在序中说：“聂子竭三十年血力，手胼足胝而为此书。”恐怕也不确切。
《续指月录》书前有康熙十九年（公元一六八〇年）正月古歙江湘的序、蒲阳余怀的《续指月录序》、如是居士吴绮园的《募刻续指月录弁语》、灵岩学人范国禄的《题记》、虞山海印学人陈见龙的《缘起》，以及《孙孝则先生书问》《续指月录总目》《续指月录凡例》《虎丘、径山二祖长少伦叙考》《续指月录卷首》。书末有《续指月录尊宿集》。
全书由《卷首》一卷、正文二十卷、《尊宿集》一卷，三部分组成。通常说的《续指月录》二十卷是指正文而言。正文所收世次，上始六祖下第十七世，下至六祖下三十五世。全书第一人为临济宗杨岐派虎丘绍隆的弟子天童昙华，最后一人为曹洞宗廪山常忠的弟子寿昌慧经。《卷首》是收载《指月录》特别是其中六祖下第十六世中遗载的人物，共六十三人。《尊宿集》是仿效《指月录》当中的“应化圣贤”和“未详法嗣”而设立的，共收六十一人。
由于编者是清代人，许多地名都已发生变化，所以把过去地名一律改作清代地名。例如“临安灵隐”便改作“杭州灵隐”。
聂先在编著精神上也是继承瞿氏而来。他在《凡例》中说：“兹录原承瞿先生以儒论禅，便于观览，并无人我。”
关于《续指月录》的价值，聂先自己作的《凡例》以及江湘、余怀二序都做了说明。聂先说：
虞山瞿幻寄先生《指月录》一书，……为禅林秘宝。……儒者谈禅之书，未有盛于此本者也。但前录自七佛起，至六祖以下凡十六世而止。宋孝宗隆兴年后，隆、杲诸老以下无传焉。兹刻以隆兴二年为始，自十七世续起，迄今康熙十八年，三十八世而止。上下五百年，续佛慧命，靡放或遗。
江湘说：
吴门聂子乐读者，研究经史，复沉酣于宗门家言。续瞿公幻寄《指月录》，缉宋南渡后上下五百年宗乘微言，钩索源流，详核世派，汇为一书。
余怀说：
或者曰：“然则聂子之续是录也，功乎过乎？”余应之曰：“若聂子则有功而无过者也。何以言之？前录迄南宋隆兴而止，隆兴以后，三十八世之宗派，上下五百年之慧灯，茫然无所知也。若无续录以续佛慧命，则绝续不辨，品位不定，语句不分，习禅之人如瞽无相，安能如猓国狼，暗中嗅金哉？故曰聂子有功而无过。”
可见《续指月录》不仅是上承《指月录》的精神的一部续作，而且还具有《指月录》所没有的继宗派、传慧灯的作用。因为《指月录》虽然也是纲目明确，但以前的各种灯录已做得很好，而后来的许多灯录之类的著作在这方面做得不那么好，以至引起人们的不满。所以聂氏续录不仅有“指月”之用，而且有“传灯”之功。
总之，《指月录》以及《续指月录》是与各种灯录并行的类似灯录，又意在指示人们悟入佛法的著作。由于编者编集极为勤苦，所选极其精粹，因而受到广泛欢迎，影响极大。可以说，它出于灯录，而又胜于灯录。